Forskjell mellom versjoner av «Avdekking av proteinstruktur»
(→Relevans for nanoteknologi) |
(→Allerede kjente strukturer - The Protein Databank (PDB)) |
||
| Linje 12: | Linje 12: | ||
== Allerede kjente strukturer - The Protein Databank (PDB) == |
== Allerede kjente strukturer - The Protein Databank (PDB) == |
||
| − | + | Protein databanken er en internasjonal databank bygget opp av forskere fra hele verden. Databanken inneholder strukturelle data for over 56000 proteiner og andre makromolekyler. Databanken oppdateres jevnlig av forskere i hele verden. Alle som ønsker data har gratis tilgang til databanken, men man må ha programvare for å analysere dataene. |
|
Dataene ligger lagret som x-, y- og z-koordinater og annen informasjon om atomene. For eksempel hvilken struktur de tilhører, og om aminosyrene har ulike konformasjoner. Ved hjelp av dataprogram kan en dermed vise hvilke deler av proteinet man ønsker. |
Dataene ligger lagret som x-, y- og z-koordinater og annen informasjon om atomene. For eksempel hvilken struktur de tilhører, og om aminosyrene har ulike konformasjoner. Ved hjelp av dataprogram kan en dermed vise hvilke deler av proteinet man ønsker. |
||
Revisjonen fra 14. apr. 2009 kl. 08:40
(siden er under konstruksjon - om noen skulle lure på det)
Denne artikkelen er en del av litteraturprosjektet "Solving 3D structure of proteins, relation to nanotechnology" i emnet TFY4335 - Bionanovitenskap.
Innhold
Introduksjon
bakgrunn, historie
Hva menes med proteinstruktur?
Strukturen til proteiner blir gjerne inndelt i primær-, sekundær-, tertiær- og kvartærstruktur. Dette svarer henholdsvis til proteinets aminosyresekvens, repetitive konformasjoner utgjort av proteinets ryggrad, proteinets tre-dimensjonale atomstruktur og individuelle peptidkjeders orientering i forhold til hverandre <ref name="proteinstruktur"> P. Y. Bruice
Essential Organic Chemistry, Pearson Education Inc. 2006, pp. 448-456.</ref>. I denne artikkelen fokuseres det på proteiners tre-dimensjonale atomstruktur, og avdekking av disse. Her vil derfor begrepet proteinstruktur bli brukt synonymt med en tre-dimensjonal atommodell av proteinet.
Allerede kjente strukturer - The Protein Databank (PDB)
Protein databanken er en internasjonal databank bygget opp av forskere fra hele verden. Databanken inneholder strukturelle data for over 56000 proteiner og andre makromolekyler. Databanken oppdateres jevnlig av forskere i hele verden. Alle som ønsker data har gratis tilgang til databanken, men man må ha programvare for å analysere dataene. Dataene ligger lagret som x-, y- og z-koordinater og annen informasjon om atomene. For eksempel hvilken struktur de tilhører, og om aminosyrene har ulike konformasjoner. Ved hjelp av dataprogram kan en dermed vise hvilke deler av proteinet man ønsker.
Strukturbestemmelsesmetoder
(hvilke er de mest brukte metoder)
(nevne kjapt metoder som ikke gjennomgås her)
Røntgenkrystallografi
Nukleær-magnetisk resonnans (NMR)
Relevans for nanoteknologi
Proteiners interaksjon med nanostrukturer
Proteinstrukturer som byggeblokker
Design av legemidler
Relevante sider
Lenker
- [zzz]
Kilder
<references/>
