Forskjell mellom versjoner av «Avdekking av proteinstruktur»

Fra Nanowiki
Hopp til: navigasjon, søk
(Allerede avdekte strukturer - The Protein Databank (PDB))
(Allerede kjente strukturer - The Protein Databank (PDB))
Linje 12: Linje 12:
   
 
== Allerede kjente strukturer - The Protein Databank (PDB) ==
 
== Allerede kjente strukturer - The Protein Databank (PDB) ==
  +
PDB inneholder strukturelle data for over 56000 proteiner og andre makromolekyler. Databanken oppdateres jevnlig av forskere i hele verden. Alle som ønsker data har gratis tilgang til databanken, men man må ha programvare for å analysere dataene.
  +
Dataene ligger lagret som x-, y- og z-koordinater og annen informasjon om atomene. For eksempel hvilken struktur de tilhører, og om aminosyrene har ulike konformasjoner. Ved hjelp av dataprogram kan en dermed vise hvilke deler av proteinet man ønsker.
   
 
== Strukturbestemmelsesmetoder ==
 
== Strukturbestemmelsesmetoder ==

Revisjonen fra 3. apr. 2009 kl. 20:11

(siden er under konstruksjon - om noen skulle lure på det)

Denne artikkelen er en del av litteraturprosjektet "Solving 3D structure of proteins, relation to nanotechnology" i emnet TFY4335 - Bionanovitenskap.

Introduksjon

bakgrunn, historie

Hva menes med proteinstruktur?

Strukturen til proteiner har tradisjonelt vært inndelt i primær-, sekundær-, tertiær- og kvartærstruktur. Dette svarer henholdsvis til aminosyresekvens, spesielle funksjonelle grupper, proteinets totale form og proteinkompleksers form (kilde Paula Bruice). I denne artikkelen vil imidlertid begrepet proteinstruktur være synonymt med en tredimensjonal atommodell av proteinet.

Allerede kjente strukturer - The Protein Databank (PDB)

PDB inneholder strukturelle data for over 56000 proteiner og andre makromolekyler. Databanken oppdateres jevnlig av forskere i hele verden. Alle som ønsker data har gratis tilgang til databanken, men man må ha programvare for å analysere dataene. Dataene ligger lagret som x-, y- og z-koordinater og annen informasjon om atomene. For eksempel hvilken struktur de tilhører, og om aminosyrene har ulike konformasjoner. Ved hjelp av dataprogram kan en dermed vise hvilke deler av proteinet man ønsker.

Strukturbestemmelsesmetoder

(hvilke er de mest brukte metoder)

(nevne kjapt metoder som ikke gjennomgås her)


Røntgenkrystallografi

Nukleær-magnetisk resonnans (NMR)

Relevans for nanoteknologi

Relevante sider

Lenker

  • [zzz]

Kilder

<references/>